一、關(guān)于跨市州匯總納稅企業(yè)年度應(yīng)納稅所得計算申報問題
跨市州匯總納稅企業(yè)的年度所得稅申報，實行逐級匯總制度。
1.三級機構(gòu)年度終了必需填報《中華人民共和國企業(yè)所得稅年度申報表》Ａ類主表、附表一、附表二、附表三，一式三份隨同財務(wù)報表一同報送主管國稅機關(guān)，主管國稅機關(guān)受理申報后，留存一份，其中兩份蓋章后退還三級機構(gòu)，三級機構(gòu)留存一份，一份交二級機構(gòu)。上述表格填報口徑按照填表說明中的口徑填寫，其中主表僅需填列前２１行，附表三只填寫帳載金額和稅收金額。資產(chǎn)在分支機構(gòu)之間轉(zhuǎn)移的，不計算收入與成本。
2.二級機構(gòu)必須匯總?cè)壏种C構(gòu)申報表和本級數(shù)據(jù)后填寫《中華人民共和國企業(yè)所得稅年度申報表》主表、附表一、附表二、附表三，一式三份，并附下級機構(gòu)和本級的申報資料及財務(wù)報表一同報送主管國稅機關(guān)；受理申報后，留存一份，其中兩份蓋章后退還二級機構(gòu)，二級機構(gòu)留存一份，一份交總機構(gòu)。填寫內(nèi)容同上。
3.總機構(gòu)必須在匯總下一級分支機構(gòu)申報表和本級數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)上，嚴(yán)格按照稅法規(guī)定填報《中華人民共和國企業(yè)所得稅年度稅申報表》。
4.總機構(gòu)在年度終了后5個月內(nèi)，應(yīng)依照法律、法規(guī)和其他有關(guān)規(guī)定進行匯總納稅企業(yè)的所得稅年度匯算清繳。各分支機構(gòu)不進行企業(yè)所得稅匯算清繳。
5.總機構(gòu)主管國稅機關(guān)受理申報后，總機構(gòu)應(yīng)將經(jīng)所在地主管國稅機關(guān)受理蓋章的《中華人民共和國企業(yè)所得稅年度申報表》（復(fù)印件）分發(fā)給分支機構(gòu)，報分支機構(gòu)主管國稅機關(guān)備案。
二、關(guān)于分支機構(gòu)稅款分配比例的計算問題
1.分支機構(gòu)經(jīng)營收入，是指分支機構(gòu)在銷售商品或者提供勞務(wù)等經(jīng)營業(yè)務(wù)中實現(xiàn)的全部營業(yè)收入，即分支機構(gòu)填報的《中華人民共和國企業(yè)所得稅年度申報表》附表一中第一行。
計入分支機構(gòu)收入形成損失后，在分支機構(gòu)主管稅務(wù)機關(guān)進行審核并出具證明，由總機構(gòu)據(jù)此計算損失金額。
2.分支機構(gòu)職工工資，是指分支機構(gòu)為獲得職工提供的服務(wù)而給予職工的各種形式的報酬及其他相關(guān)支出，包括在上級機構(gòu)列支發(fā)放給本機構(gòu)的職工工資，即分支機構(gòu)填報《中華人民共和國企業(yè)所得稅年度申報表》附表三中第二十二行申報數(shù)。
3.分支機構(gòu)資產(chǎn)總額，是指分支機構(gòu)擁有或者控制的除無形資產(chǎn)外能以貨幣計量的經(jīng)濟資源總額。
由上級機構(gòu)統(tǒng)一購買(融資租賃)或自行購建的資產(chǎn)撥付下級機構(gòu)使用的，無論其折舊、攤銷是否由分支機構(gòu)計算，上級機構(gòu)必需出具資產(chǎn)購買合同、撥付使用清單，計入分支機構(gòu)資產(chǎn)總額，不再計入上級機構(gòu)資產(chǎn)總額。其資產(chǎn)損失在分支機構(gòu)主管稅務(wù)機關(guān)進行審核并出具證明，由總機構(gòu)據(jù)此計算損失金額。
分支機構(gòu)應(yīng)建立資產(chǎn)清冊，對資產(chǎn)發(fā)生變化的應(yīng)向主管國稅機關(guān)報備。
4.分支機構(gòu)所在地主管國稅機關(guān)對上級機構(gòu)計算確定的分?jǐn)偹枚惪畋壤挟愖h的，應(yīng)于收到《中華人民共和國企業(yè)所得稅匯總納稅分支機構(gòu)分配表》后30日內(nèi)向上級部門提出書面復(fù)核建議。
分支機構(gòu)上級機構(gòu)在同一市州的由市（州）國家稅務(wù)局在收到復(fù)核建議后30日內(nèi)，對分?jǐn)偠惪畹谋壤M行復(fù)核，并作出調(diào)整或維持原比例的決定。
分支機構(gòu)與上級機構(gòu)不在同一市州的，由市（州）國家稅務(wù)局向省國家稅務(wù)局提出復(fù)核建議，由省國家稅務(wù)局進行復(fù)核。
分支機構(gòu)所在地主管國稅機關(guān)應(yīng)執(zhí)行上級部門的復(fù)核決定。
三、關(guān)于分支機構(gòu)稅款分配問題
分支機構(gòu)分配稅款應(yīng)當(dāng)按照國家稅務(wù)總局《跨地區(qū)匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理暫行辦法》（國稅發(fā)[2008]28號）計算預(yù)繳。
1.二級及以下分支機構(gòu)在同一市（州），其三級分支機構(gòu)分配方式由所在市（州）國家稅務(wù)局決定，其可分配稅款為總機構(gòu)分?jǐn)傊猎摱墮C構(gòu)的稅款。
2.二級及以下分支機構(gòu)不在同一市（州、直管市、林區(qū)），其分支機構(gòu)稅款分配方式及繳納方式由省國家稅務(wù)局決定。
3.特殊情況由省國家稅務(wù)局另行通知。
四、匯總納稅企業(yè)評估和檢查問題
1.分支機構(gòu)主管國稅機關(guān)在年度終了5個月以后，可對分支機構(gòu)收入與扣除項目進行評估和檢查，對發(fā)現(xiàn)少計收入、多計支出項目，可對企業(yè)少計算的應(yīng)納稅所得就地補稅，并以正式函件通知總機構(gòu)主管國稅機關(guān)，對于影響分支機構(gòu)分配比例的，企業(yè)應(yīng)當(dāng)及時調(diào)整分配比例。
如總機構(gòu)辦理延期申報，對分支機構(gòu)的評估和檢查應(yīng)當(dāng)在總機構(gòu)年度申報結(jié)束后方可進行。
2.查補稅款不作為當(dāng)年或以前年度就地預(yù)繳的稅款，不參與企業(yè)的匯繳清算。
本公告從2010年度匯算清繳開始執(zhí)行。
